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FeatVec.h

00001 
00002 // Copyright (c) 2003, The Institute for Genomic Research (TIGR), Rockville,
00003 // Maryland, U.S.A.  All rights reserved.
00005 #ifndef FEATVEC_H
00006 #define FEATVEC_H
00007 
00008 #include "EvidenceType.h"
00009 #include <vector>
00010 
00011 using std::vector;
00012 
00020 class FeatVec : public vector<EvidenceType*> {
00021  public:
00026   FeatVec(int size) : vector<EvidenceType*>(size) { }
00027   FeatVec(const FeatVec&);
00028 
00029   /*
00030    * calls delete for on each element
00031    */
00032   ~FeatVec();
00033 
00037   void normalize();
00038 
00039   AnnotationScore sumEval() const;
00040 
00044   int getNumDim() const;
00045 
00049   float* toFloatArr(float*,unsigned) const;
00050 
00055   void elem_normalize();
00056 
00061   void setVals(const FeatVec&);
00062 
00066   std::ostream& val_print(std::ostream&) const;
00067 
00072   friend double operator-(const FeatVec&, const FeatVec&);
00073 
00074   void finish();
00075 
00076 };
00077 #endif // FEATVEC_H